Este sistema de cuevas fue descubierto en 1980, y forma parte del Parque Arqueológico de Arte Rupestre Naj Tunich y fue declarado, el sitio, como Patrimonio Cultural y Natural de la Nación Guatemalteca desde el 8 de febrero de 1985.
Esta cueva tiene una longitud de cerca de 3 kilómetros, en los cuales se pueden observar formaciones n pinturas, grabados y huellas de manos, del periodo clásico tardío de los mayas. Asimismo, cuenta con dos altares los cuales hacen suponer que este sitio fue de índole religioso para los mayas.
Cabe mencionar que el sitio como tal se encuentra cerrado al público pero las réplicas de las pinturas se encuentran en otra cueva a lado de la original y se puede, efectivamente, visitar la entrada de dicha cueva.
Se encuentra ubicada en la Villa La Compuerta, en el municipio de Poptún, Petén.
El lugar fue descubierto en el año 1980 aproximadamente por un cazador llamado Bernabé Pop. Desde ese momento se inició una serie de investigaciones en el área. De hecho, se estableció que la Cueva Naj Tunich es uno de los sitios arqueológicos más importantes en la cultura maya que habitó Guatemala.
En el interior de esta cueva fue descubierta una gran riqueza en arte de casi más de 2,000 años de antigüedad. Se encontraron glifos grabados en rocas, artefactos de cerámica, jade, elementos de arquitectura maya y tumbas.
Según las investigaciones, la Cueva de Naj Tunich fue un sitio sagrado activo desde el año 100 a. C. hasta el año 900 d. C. En el año 1998 la cueva fue clausurada por el Gobierno de Guatemala. Esto se hizo para resguardar los glifos mayas originales que se encuentran en ella.